如何使用NCBIBLAST

2017年10月25日—在本篇網誌中將使用課程所介紹的NCBI以及ProK來了解AMO這個蛋白質從核酸序列、基因到蛋白質的一些資訊。首先,從NCBI首頁左欄allresourse可以 ...,,許多需要做物種序列比對的人都用過NCBI的BLAST(BasicLocalAlignmentSearchTool)網頁服務,其實他們也有推出單機版的一系列程式BLAST+executables,最新版可以從 ...,Blast使用指南;1.了解存储sequence的常用文件格式;FASTA格式(.fastaor.fa);2.安装blast及其子...

序列比對

2017年10月25日 — 在本篇網誌中將使用課程所介紹的NCBI 以及ProK 來了解AMO 這個蛋白質從核酸序列、基因到蛋白質的一些資訊。 首先, 從NCBI 首頁左欄all resourse 可以 ...

BLAST+ 的安裝與基礎使用

許多需要做物種序列比對的人都用過NCBI 的BLAST(Basic Local Alignment Search Tool)網頁服務,其實他們也有推出單機版的一系列程式BLAST+ executables,最新版可以從 ...

2.1 序列比对- Blast使用指南

Blast 使用指南 ; 1. 了解存储sequence的常用文件格式 ; FASTA格式(.fasta or .fa ) ; 2. 安装blast及其子程序blastn, blastp,blastx, ... ; 3. 阅读命令帮助

BLAST

2023年5月21日 — BLAST,代表基本局部比對搜尋工具,是一種廣泛使用的生物資訊學程序和演算法。 它旨在比較和分析生物序列,例如DNA、RNA 和蛋白質 序列。

NCBI BLAST比对结果详细分析

写在解读报告之前的,首先就使用Blast最终的目的是什么达成一致,Blast是通过两两比对,找到数据库中与输入序列最相似的序列,或者说是最相似的序列片段。那么我们看比对 ...

如何使用NCBI进行blast比对

2020年3月20日 — 点击上图中“Nucleotide BLAST”,打开比对界面,粘贴或者上传需要比对的序列,选择数据库、填入物种,调整各个参数(一般默认即可),点击BLAST进行比对。

NCBI在线BLAST使用方法与结果详解

BLAST(Basic Local Alignment Search Tool)是一套在蛋白质数据库或DNA数据库中进行相似性比较的分析工具。BLAST程序能迅速与公开数据库进行相似性序列比较。

NCBI使用教程:基因序列对比最快的方法

2021年11月2日 — BLAST是“局部相似性基本查询工具”(Basic Local Alignment Search Tool)的缩写。是由美国国立生物技术信息中心(NCBI)开发的一个基于序列相似性的 ...

如何使用NCBI进行序列比对(alignment)?

这时候,我们需要利用BLAST(Basic Local Alignment Search Tool)工具对这条序列进行序列比对(alignment),即在已知的一个序列数据库中,找到相似或者一致的序列。通过 ...